Genomik Islah Asistani — Genel Bakis

Klasik bitki islahini (8-12 yillik tarla denemesi) genomik tahmin + yapay zeka destekli secim sistemine donusturen platform. Su an Capsicum annuum (biber) icin gelistirildi, mimari tum tahil/sebze turlerine genisletilebilir.

Sistem Ne Yapar?

  • MAS (Marker-Assisted Selection): Bilinen major-gene markerlarinda (Pun1, Bs2, L, pvr2, Tsw) aksesyon allele state'i kontrol eder; kritik markerda fail varsa elenir.
  • GEBV (Genomic Estimated Breeding Value): SNP genotip matrisinden trait tahmini yapar. Mevcut: meyve uzunlugu / genisligi / sekil indeksi (R²=² = 0.27-0.29).
  • Hibrit Selection: MAS + GEBV birlestirilir, agirlikli combined index ile aksesyon siralamasi yapilir.
  • Genom Sorgu: 500 aksesyonun istenen kromozom bolgesinde dosage matrisi (cache'li, 21 ms tekrar sorguda).
Su anki R² ~0.27 baseline seviyesidir. Faz 3'te gercek GBLUP (sommer R) + 50K SNP feature ile R² 0.55-0.65 hedeflenir.